机构设置

　　科学研究院负责研究制定学校科技发展规划和科技管理政策；组织开展科研创新人才培育与团队建设；科研创新平台的规划、建设、管理与评估；各级各类科研项目谋划申报、过程管理与评价考核；科研成果推广与产学研；各级各类科技奖励组织、申报与管理。科学研究院下设4个处，分别为规划与综合处、平台处、基础处和产学研处。

规划与综合处（中山大学科学技术协会秘书处）

　　负责综合协调、督办督查、内控建设和对外联络；推动学科交叉融合；理工医科高校基本业务费项目申报与管理；统筹科研重点发展项目预算执行和绩效评价；信息化建设、科研统计和动态监测、科研宣传和文化建设；引进人才科研启动费技术服务合同审核；科技伦理、人类遗传资源安全管理；协会、学会及科协建设；负责科技战略规划、科技成果奖励组织谋划、申报与过程管理；公文、印信、人财物档案、后勤保障、出访审批和会务接待等综合事务。

平台处

　　负责重大科研平台的规划和培育，校内重大科研平台建设和运行管理；多学科交叉科研平台规划与建设；理工农医各级科技创新基地申报与管理（不含企业）；理工医校内机构的管理；科研实验室搬迁方案/维修工程立项论证。

基础处

　　负责科技人才培育；国家重点研发计划、国家科技重大专项、国家自然科学基金等各类国家级科技计划项目申报与管理；广东省基础与应用基础研究基金项目申报与管理。

产学研处（中山大学技术转移中心、大学科技园管理办公室）

　　负责学校与企业、地方科技合作，知识产权管理、科技成果转化，广东省以及广州市、深圳市、珠海市等省市科技计划项目申报与管理。“大学科技园管理办公室”挂靠在产学研处，负责大学科技园行政管理、创新创业教育、概念验证中心及小试中试平台组织申报管理、科技企业孵化、对接大学科技园公司等。